抗甲状腺药物(硫脲类)治疗可以发生一些副作用，如药物性皮疹、粒细胞缺乏症、白细胞减少症、关节痛、肌肉痛、头痛、药物热、肝损害等。总的发生率为3%一7%，其中以药物性皮疹最为常见，以粒细胞缺乏症最为严重。有人统计了药物性皮疹及粒细胞缺乏症的发生率，药物性皮疹的发生率为2%一5%，粒细胞缺乏症的发生率为0.1%一0.8%。出现药物性皮疹等副作用时，如果不严重，减少剂量或者换用另一种药，副作用可以消失。如果副作用严重，或减少剂量及换药不能消失，则需停止用药。出现粒细胞缺乏症时必须停用药物，并需采取紧急抢救措施进行治疗。