尿路的各个部位都可以发生结石。根据有关单位的统计，肾结石的发病率最高，达到47.4%；输尿管结石占32.6%。实际上，绝大部分输尿管结石是在肾脏内形成然后下降到输尿管的。从解剖学的观点看，输尿管有三个生理性的狭窄段，即肾盂输尿管交界部、输尿管中段与髂血管交界处和输尿管的膀胱壁间段，这三个部位都是输尿管结石最常停留的部位。膀胱结石仅占16.2%，尿道结石占3.8%。位于膀胱和尿道的结石中也有一部分是从肾脏和输尿管下降而来的。
由此可见，尿石症的发病部位主要是在肾脏。
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