研究奠定了基础。
2.克隆技术发展为差异表达基因的获取提供了技术保障。
差异表达基因克隆技术十分成熟,特别是差异展示技术的发展与成熟,为短期内分离并克隆正常胃粘膜到癌前变、再到胃癌的差异表达基因奠定了基础。
3.芯片技术的发展与成熟为差异表达基因的临床研究奠定了基础。
芯片技术的发展与成熟为大量基因的功能性研究提供了条件,同时也提高了效率,为短期内获得大量数据提供了可能。
4.部队的科研管理及严格的组织性为多单位科研协作完成课题奠定了基础。
五、本研究经费概算及建议承担单位
1.经费概算
(1)胃粘膜(胃窦、胃体、胃幽门)到胃癌前变(胃窦、胃体、胃幽门)差异表达基因的分离与克隆,需经费50万元;
(2)胃癌前变(胃窦、胃体、胃幽门)到胃癌差异表达基因的分离与克隆,需经费50万;
(3)克隆的差异表达基因在临床标本中的检测及其临床意义研究,需经费50万元;
¬ 特异性差异表达基因的筛选;
差异表达基因临床运用数据库的建立;
® 相关检索分析软件的开发与运用。
2.建议承担单位
第四军医大学全军基因诊断技术研究所、北京医科大学肿瘤医院、西安市中心医院、西京医院消化病研究所等单位联合承担。
第四军医大学全军基因诊断技术研究所运用DD-PCR技术分离并克隆了部分胃癌与癌前变粘膜之间的差异表达基因,对DD-PCR技术掌握很熟练,分离出胃癌相关基因片段154个,完成部分片段的测序,筛选20个是新序列并被GenBank接受(接受号为AF054162-AF064172,AF071052-AF071058),对其中的二个基因片段进行了cDNA文库的筛选及染色体定位,运用RT-PCR及RNA 杂交技术对68例胃癌及癌旁组织与100例活检胃粘膜标本进行了检测,筛选出6个特异性好、组合检出符合率达92.3%的新基因片段,初步组成胃癌早期预警系统,这6个基因序列已被GenBank接受,并申请了中国专利(接受号为98112922.6)。对完成基因筛选工作奠定了基础;
北京医科大学肿瘤医院、西安市中心医院、 西京医院消化病研究所承担并完成了多项重点科研课题,具备完成此研究的标本收集及有关技术条件。
胃癌早期诊断及预警基因芯片
胃癌的发病率在我国居恶性肿瘤之首,在世界居第二位。研究表明:胃癌是一种基因病,正常胃粘膜到癌前变及胃癌皆存在特征性差异表达基因,找出这些基因并阐明这些基因表达水平的变化与胃癌发生发展不同阶段的相互关系及其规律,建立起这些特征基因变化规律的数据库就能预报胃癌。
籍此,我们利用基因打猎技术获得了229个胃癌发展各阶段的特异基因,并将这些基因种植到特殊处理的载体上,制备成基因芯片,从而实现对胃癌的早期诊断和预警。
该芯片的研制成功,对于胃癌高危人群的普查,胃癌的早期诊断及治疗效果分析,预后评价等均有重大的现实意义,同时也可产生良好的经济效益。