至今尚无满意的痢疾菌苗得到公认，尚无满意的菌苗提供人群使用后能达到预想的结果。但是国内外基础研究的结果表明，不同型、群的痢疾菌株，不仅存在毒力相关的大质粒、高度同源、又高度特异的侵袭去氧核糖核酸片段，还有相似的侵袭外膜蛋白，这些共同性为今后研制多价痢疾菌苗指出了可喜的光明前景。但是在自然流行中，菌痢病后仅提供不长时间的型特异保护，灵长类口服痢疾菌苗攻击试验表明，缺乏型间交叉保护，说明上述共性所见在菌苗中的作用可能很小。但启示人们能否对其共性进行人工改造修饰，从而使菌苗对肠粘膜的保护相关作用都能模仿自然感染产生的免疫反应；并借助其它受体菌或佐剂去增加延长粘膜保护作用。事实说明要构建安全、有效、多价痢疾菌苗的难度还相当大。仍需多学科协作，需要作基因水平、分子水平、细胞水平与器官和整体水平的交错研究，目的是获得保护性抗原的结构基因，构建出合适的载体与表达系统，选出适宜的受体株，构建出能刺激肠粘膜局部免疫及防卫机制的痢疾工程菌苗，以达到用菌苗来真正预防痢疾。