拉咪呋定长期治疗引起HBVDNAYMDD变异的研究

时间:2006/9/1 23:15:34   文章来源:不详    作者:佚名  

文章导读:

  乙型肝炎病毒感染导致的肝炎,发展为慢性肝炎、肝炎后肝硬化、肝细胞性肝癌。新一代核苷类抗病毒药物,如拉咪呋定、法昔洛韦等治疗HBV感染,日益受到重视,它可以插入新的病毒DNA链中,抑制HBVDNA聚合酶的活性,从而阻止了HBVDNA的合成,使得HBV DNA转阴。但是,在治疗过程中,部分病人出现血清HBVDNA聚合酶基因区的保守序列YMDD(络氨酸一蛋氨酸一天冬氨酸一天冬氨酸)基因变异,其中最常见编码蛋氨酸的552位点出现了核苷酸的替代,目前已经报道的主要有两种常见的变异形式即M552V、M5521对治疗产生了耐药。为了建立一种快速,简便,经济,特异的检测HBVDNA变异的方法,研究拉咪呋定治疗过程中出现的HBV基因变异的问题,我们利用限制性片断长度多态性分析方法作了如下研究。

  材料与方法

  1.研究对象:240例拉咪呋定(100mR/日口服)治疗的慢性乙型肝炎病人血清标本,收集自北京佑安医院门诊及住院病人。

  2.方法:设计错配引物应用巢式PCRRFLP方法扩增HBVDNA,由于YMDD基因区没有任何酶切位点,在引物设计中引人Nde I和NLaⅢ酶切位点,参照Mrchelle的方法。

  3.HBV DNA纯化:采用常规蛋白酶K消化,酚抽提的方法。

  4.HBV DNA外引物扩增位点:50ul反应体积中含有10 XPCR缓冲液5ul,P1,R1引物各0.5ul,dNTP各200mM,Taq酶2u,模板20ul,循环反应条件94~C,5min;94℃,45s;55~C,45s;72℃,45s;共35个循环72~C,7rain延伸。扩增552位点:PCR循环加入F2、R2引物各0.5ul,其它条件与以上相同。扩增528位点:取第一次PCR产物10ul,F3,R2引物各0.5ul,余条件与以上相同。分别取552、528位点扩增产物lOul,2%琼脂糖凝胶电泳后,紫外透射分析仪观察结果。HBV DNAPCR阳性的产物进行酶切分析。

  5.限制性内切酶分析:10ul酶切反应体系中含有Ndel2ul,(或NLaⅢ)酶切缓冲液2ul,产物6ul;37消化1小时。紫外透射分析观察结果。

  6.HBVDNA定量PCR测定:AG9600定量基因扩增仪,HBVDNA定量PCR检测试剂(AcuGenHBVQuantitativeTest)美国Biotronics公司提供,按操作说明书规定进行操作,HBV DNA水平用每m1血清HBV DNA模板起始拷贝数表示,测定的临界值为1X104。

  7.HBV克隆测序:三例PCR扩增阳性产物(RLFP方法分析为野毒株一例、M552V伴L528M变异1例、M5521变异1例)经低熔点琼脂糖纯化后,在连接酶作用下与载体PGEM—T Vector(美国Promega公司)在16''12水浴连接过夜,转化Top大肠杆菌。在IPTG和X—gal存在的条件下,挑取含有目的基因片断的白斑,用PCR方法鉴定阳性克隆后,进行基因测序分析。

  结  果

  一、YMDD变异测定结果

  240例拉咪呋定治疗的慢性乙型肝炎病人血清测定HBVDNAYMDD,其中51例发生变异。

  1.552位点变异(用PCR—RFLP方法,引物F2、R2扩增产物经酶切分析):在拉咪呋定治疗中HBVD-NA聚合酶YMDD位点产生了变异,使得HBV DNA的原靶序列ATG发生了变化,引入的NdeI酶切位点缺失,从而产生119bp的变异株条带;在野毒株中引入的酶切位点存在并可以被酶消化切开,所以产生了99bb和20bp个的两个片段,20bp的小片段与引物带参杂在一起。

  2.M552V变异:在确定了是YMDD变异后进一步分析是M552V、M5521变异,可以用NlaⅢ酶切,M552V变异,能够被此酶切开,DNA片段成为95bp和24bp的两个片段。

  3.528位点变异:除了YMDD变异以外,还存在DNA聚合酶B区528位点的变异,它是由528位亮氨 酸被蛋氨酸取代(1528M,用引物F3,R2扩增,产物是197bp,引入NLaⅢ酶切位点,如果是L552M变异,可以将其切开,形成176和22bp大小两个片段。

  4.拉咪呋定治疗240例慢性乙型肝炎患者血清HBVDNA变异的情况:240例拉咪呋定治疗的慢性乙型肝炎患者52—78周,发生血清HBVDNA变异的共51例,其中M552V变异38例,M5521变异13例L528M变异27例;M522V变异同时有L528M变异的有26例,M5521变异同时有L528M变异的1例。在552位点单一基因变异的只有24例。

  二、HBV DNA定量分析与YMDD变异的关系

  慢性乙型肝炎病人服用拉咪呋定后HBADNA迅速下降到检测水平以下,当发生耐药基因突变时HBVDNA反跳240例患者中51例发生YMDD变异,患者血清HBV DNA定量分析与HBV DNA变异的比较

  见表1。

  表1  HBV DNA定量分析与YMD变异的关系

  TablThecorrelationbetweetheHBV DNA QuantitativePCRassayand''hemutationOfYMDD51例患者血清HBVDAN变异,DNA水平升高,但是70.58%患者(36/51)其DNA水平仍在1X105以下,高水平复制HBV DNA≥1X 108为13.72%(7/51)。HBVDNA测序法比较:用DNA序列分析检测验证RFLP方法是否可行,对三例标本进行了测序,2例检出YMDD变异,(其中1例为YVDD,伴有L528M变异,1例为YIDD变异)l例是野毒株(见表2)。

  表2  3例患者核耷酸序列测定编码的HBVP基因区氨基酸序列

  Table 2 HBV P gene range aminO acids sequence in 3 patients

  FRKTPMGVGLSPFLLAQFTS  AECSVVRRAFPHCLAFSYM D  DVVLGAKSVQHL

  三、ALT水平变化与YMDD变异的关系

  51例发生YHDD变异的患者在治疗52周-78周时34例ALT上水平明显高于无变异患者组(52周76.7+27.9L匕27.9+10.1,P:0.001;78周66.7+57.6L匕27,3+21.2,P:0.001),治疗52周时,23例变异的患者中16例ALT升高,2例病人高于治疗前水平,伴血清胆红素升高,因而再次住院治疗。治疗78周时,28例变异患者中18例ALT升高,不论HBVDNA变

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