菌痢是常见和多发传染病。1988年国外曾报道，全世男菌痢年发病数为几千万例，死亡数约60万。主要在发展中国家广为流行。我国1990年前的统计，年发病为200万一306万例，实际病例数据流行病专家推测还应高2.3倍。菌痢由我国是仅次于肝炎的第二位传染病，是国内分布最广的腹泻病。在野外大型作业的群体或有军事行动的部队里，菌痢发病率要比平时高2—4倍，因菌痢流行影响施工进程和军事任务的事例在国内外均有所见。但只要能改善卫生大环境，加强个人卫生，注意营养，杜绝病从口入的条件，就能明显降低菌痢的发病率，然而对多数发展中国家来说实难做到。另外，菌疾虽有治疗药物，但抗药问题日益严重，加上治疗不及时，每年总有10%的宋内氏和福氏菌痢的急性发病者转为慢性，成为重要的传染源。因此世界卫生组织1989年已将痢疾菌苗列为全世界5种重点研制的菌苗之一，且预测10年内将会有新一代的痢疾菌苗用于人群。