长期以来，将大便镜检高倍视野白细胞5个以上，作为菌痢与肠炎的鉴别。近十余年来，随着对感染性腹泻病原学研究的不断深入，发现这样的看法是错误的。“5个白细胞”的划分标准不科学，少数菌痢大便镜检白细胞，可以在5个以下，空肠弯曲菌肠炎等很多其它感染性腹泻常常在5个以上。1987年卫生部统一规定，将腹泻分为非感染性腹泻与感染性腹泻，凡属感染性腹泻，统称之为肠炎，找到确切病原者，称之为×××肠炎。例如，大便培养为空肠弯曲菌，则称空肠弯曲菌肠炎。但对一些沿用已久的病，仍按原有名称诊断，如由志贺氏菌引起的腹泻，应诊断为志贺氏菌肠炎，但长期以来称之为菌痢，现在仍称菌痢。所以现代观念中，菌痢只是肠炎中的—种，而肠炎不能构成一个病名诊断，而是一类疾病的总称，并替代了痢疾这个旧称。