（一）MCTD的典型临床表现包括：多关节炎、雷诺现象、肿胀手或指端硬化、肺部病变、肌炎和食道运动减弱等。此外还伴有发热、淋巴结肿大、脱发、颜面部红斑、浆膜炎和心脏肾脏病变，但较为少见。
　　　约80%的MCTD患者有皮肤损害，主要表现为手和手指肿胀，大约有2/3患者手指呈腊肠样改变。约有40%的患者有狼疮样皮疹，狼疮带实验可呈阳性。由于手指或足趾小动脉多发性痉挛，85%的MCTD患者有雷诺现象。有75%的患者发现非畸形性多发性关节炎。有些患者可出现多发性肌炎表现，四肢近端肌肉常有压痛和无力，血清肌酸肌酶和谷草转氨酶明显升高，做肌电图检查示肌源性损害。患者食道检查显示运动减弱，但多无吞咽困难症状，可表现为食管远端2/3处蠕动幅度减低和食管上下端括约肌压力降低。肺部病变约占70%，有些临床上可无呼吸道症状，有暂时性胸膜炎，可伴有少量胸腔积液，间质纤维化，肺功能测定3/4病例受损，呼吸受限，有些可出现呼吸困难和肺动脉高压。X线摄片可表现为肺基底部网状结节阴影，变换位置的肺实质变化。心脏病变主要是心包炎，尚可有心肌炎、完全性传导阻滞、心律紊乱或心力衰竭。
　　　实验室检查可见：贫血，全血细胞减少，血小板减少，血沉增快，ν球蛋白显著增高，血清中可检测出高滴度斑点型抗核抗体（ANA）和高效价的抗nRNP抗体。约半数患者可有类风湿因子阳性反应。
　　　（二）重叠综合征：
　　　1、SLE与PSS重叠。患病开始常为典型是SLE，随后出现泛发性皮肤硬化。患者张口和吞咽困难，并出现肺纤维化。患者面部红斑发生少，多有雷诺现象。血免疫球蛋白增高，ANA阳性且效价较高，主要成分为ENA抗体，抗ds-DNA抗体少且为低效价。LE细胞阳性率低。
　　　2、PSS与PM或DM重叠。。常有雷诺现象，四肢近端肌肉酸痛无力，关节炎或关节痛，食道运动减慢，肺纤维化，硬皮病性皮肤改变局限于四肢，很少见到广泛累及，可伴发恶性肿瘤。血清抗Ku，抗PNscl和U2RNP抗体阳性，具有特征性。
　　　3、SLE与PM重叠。除SLE症状外，以近端肌力降低，肌肉萎缩及硬结常见，血清ANA阳性，高ν球蛋白血症，低补体血症，白细胞减少，尿蛋白，血清肌酸肌酶，醛缩酶，ALT，LDH增高，24小时尿肌酸排量增高。
　　　4、SLE与类风湿性关节炎重叠。除SLE症状外，以类风湿结节、关节炎和关节畸形多见。血清有高阳性率和高滴度的RF因子。
　　　5、SLE与结节性多动脉炎重叠。多见周围和中枢神经系统症状、肺部症状、腹痛和皮肤结节等。血细胞计数大多正常，但常伴有嗜酸粒细胞增高，亦常见乙肝表面抗原阳性。