抗生素可以加速痢疾杆菌的消失，缩短病程，在菌痢的治疗上很重要。疗程太短，细菌尚未消除，病情迁延不愈或反复发作。但抗生素可引起肠道菌群失调，肠道免疫功能下降。任何—种抗生素，都有多方面的副作用，对身体各种脏器产生不良影响，疗程越长。副作用越多；同时，并不是疗程越长，菌痢治愈率越高。60年代，曾比较过3、5、7、10天不同疗程的疗效，结果5天疗程治愈率较高，自1965年开始，将过去的l0天疗程改为5天。80年代，应用氟哌酸等高效抗菌素痢药后，又比较了3天与5天疗程的疗效，两者治愈率近似，能以3天治疗达到5天同样的效果，当然就采用3天疗法。我们认为有效的高度敏感的抗生素用3-5天即可，抗痢药对肠道病损的修复不起作用。