麻疹并发中枢神经系统病变较其他出疹性疾病为多，发病率约1‰～2‰。多发生于出疹后2～5天，偶见于前驱期，也可在出疹后2～3周发病。早期可能由麻疹病毒直接引起，而晚期发生者多有脑组织髓鞘病变，可能与免疫反应有关。常出现高热、肢体瘫痪及呼吸衰竭。脑膜刺激征阳性，脑脊液中细胞数增至50～500/mm3，以单核细胞为多，蛋白质稍增，糖正常，病情大多危重，可留有强直性瘫痪、智力障碍、失明等后遗症。
　　亚急性硬化性全脑炎：此为一种麻疹远期并发症，属亚急性进行性脑炎，发病率约在1～4/百万。病理变化主要为脑组织退行性病变，在切片中可见麻疹病毒抗原，伴嗜酸性包涵体，并可分离到麻疹病毒。血液与脑脊液中麻疹抗体极度增高（高于急性麻疹患者10～40倍），且持续不降。患者大多在幼年时患过麻疹，故认为本病可能系麻疹病毒长期隐伏于脑组织中，产生缺失M膜蛋白的有缺陷的病毒颗粒所致，从而引起脑部进行性退化病变。故目前认为这是一种类麻疹病毒或麻疹有关病毒所引起的亚急性或慢性脑炎。潜伏期约2～17年，发病年龄以5～15岁儿童为多，多发于男孩。起病隐匿，病初仅表现为行为异常或智力减退、睡眠障碍、情绪烦躁，数周或数月中病情加重，出现特征性肌痉挛、智力异常、视听障碍、语言不清、共济失调或局部强直性瘫痪，病情发展直至神志昏迷，呈去大脑强直状态。总病程约一年余，可短至半年，长达6～7年。最后死于营养不良、恶病质及继发感染。脑脊液丙种球蛋白及抗体水平剧度增高为其特点，血液及细胞数正常，脑电图呈不规则高电压慢波。