性病性淋巴肉芽肿的治疗越早越好，初期病人用药后，全身性症状可迅速消失但局部淋巴结肿的愈合有限。晚期出现严重并发症后治疗困难，往往需行手术治疗。疗方法包括全身治疗和局部治疗。全身治疗主要是及时应用抗菌药。
常用的药有：
1、强力霉素：每次0.1g，每天2次，连服21天。
2、四环素：500mg，每天4次，连服21-28天。四环素对急性期有效，可使中停止发展，或数周后痊愈。
3、红霉素：500mg，每天4次，连服14-21天。孕妇和儿童可选用红霉素。
4、复方新诺明：开始每日2次，每次2g，以后每次1g，连服3周。替代疗法为强力霉素。
5、磺胺噻唑，首剂4.0克，以后每6小时1.0克，连用3周。
晚期患者可采用横胺剂或抗生素与皮质激素(强的松)联合疗法，能减轻下腹痛，减少直肠分泌物和减轻纤维化。
局部治疗可外用高锰酸钾水清洗外阴，对未化脓者可帖10%鱼石脂软膏或用红霉素、磺胺类软膏。淋巴结软化有波动（脓肿）形成者可在损害上方穿刺吸引脓液，并在脓腔内注入磺胺溶液。切不可作切开术，因其不易愈合。对已化脓者，可穿刺抽脓，并注入抗生素，不可切开引流，以免瘘管形成，不利愈合。对溃疡较深者，可行外科疗法，切除坏死的淋巴结。对晚期出现阴道或直肠狭窄者，须定期作扩张术。直肠狭窄严重者需做直肠切除术。有包皮及阴囊橡皮肿者，亦可手术切除。局部病灶还可以用超声波、紫外线、红外线、X线等物理疗法。
中医根据临床症状常把本病分为三型论治，即湿热夹毒证，它主要见于疾病期；痰毒积聚证，见于疾病的中期；肝肾不足证，见于疾病的后期。
性病淋巴肉芽肿的中医病因病机：(1)初起为不洁性交染毒，湿热下注，交阻生殖器部位，与气血相搏，形成鱼口或便毒。(2)热毒之后，毒热结聚肝经，肝气郁结，气滞伤脾，脾失健运，痰热内生，结于股胯，而成横痃。(3)病之后期，肝郁化火，伤及肾阴，迁延日久，则脓水淋漓，久不收口。
湿热夹毒证性病淋巴肉芽肿可见生殖器发生丘疹或水疱，或表面糜烂，有渗液。可伴有发热、纳差，舌质红，舌苔黄，脉滑数。这是由于湿热夹毒侵袭肝脉，而肝脉经络绕阴器而行，故生殖器发生丘疹或水疱，或表面糜烂，有渗液，伴有发热、纳差，舌质红，舌苔黄，脉滑数均为湿热夹毒的临床表现。治疗宜清热利湿解毒。方药常用二妙散加减：黄柏10g 苍术10g 薏苡仁30g 车前子10g 土茯苓30g 蒲公英30g。方中黄柏、苍术为主药，清热燥湿，薏苡仁、车前子配合主药清热利湿，土茯苓、蒲公英清热解毒。如湿热重者，可加入龙胆草10g，毒热重者，可加入野菊花10g。
痰毒积聚证性病淋巴肉芽肿，症见腹股沟淋巴结肿大，皮核相连，有的结核之间相互融合成块，推之不移，自觉疼痛，舌红，舌苔黄，脉弦滑。这是由于痰毒积聚气血瘀阻所引起的。治疗宜疏肝解郁，软坚散结。方药宜逍遥散合消瘰丸加减：柴10g当归10g 白芍10g 白术10g 茯苓20g 玄参20g 煅牡蛎30g（先煎）浙贝母10g 香附10g 陈皮10g 白僵蚕10g 青皮10g 法半夏10g 甘草6g。方中柴胡为药，疏肝解郁；当归、白芍养血柔肝，白术、茯苓健脾利湿；玄参、煅牡蛎、浙贝母软散结；香附、陈皮、白僵蚕、青皮、法半夏、甘草均配合主药理气、化痰，全方共奏疏肝解郁，软坚散结之效。如阴虚者，加入
