衣原体的种类很多，不同的衣原体可引起人类、鸟类及哺乳类动物（如家畜、啮齿类动物）的眼、泌尿生殖道、呼吸道、神经系统、关节、胎盘和全身感染。引起人类衣原体感染的主要病原有沙眼－包涵体结膜炎衣原体、花柳性淋巴肉芽肿衣原体和鹦鹉热衣原体。中国除沙眼衣原体引起的沙眼较普遍外，其他衣原体的感染较少见。抗生素和磺胺治疗对衣原体感染疗效很好。
衣原体 不能在人工培养基上生长，只能在寄主细胞内生长，能通过细胞滤器的微生物。因而长期以来被认为是病毒。但它又有细胞壁结构，借二分裂繁殖，含DNA和RNA二种核酸，胞浆内有核糖体，对磺胺和多种抗生素敏感，这些特性又类似细菌。1957年开始把衣原体归于细菌类，这一主张已获得越来越多的微生物学家的支持。按伯杰氏新的分类，衣原体属立克次氏体纲衣原体科。衣原体属Ⅰ为沙眼衣原体组衣原体，这组衣原体在寄主细胞浆内形成致密型包涵体，其中含有丰富的糖原，碘染色阳性。对磺胺药和环丝氨酸类药物高度敏感。衣原体属Ⅱ为鹦鹉热衣原体组衣原体，这组衣原体在寄主细胞浆内的包涵体呈疏松型，不含糖原，碘染色阴性，对磺胺药不敏感，对环丝氨酸类药物低度敏感。
根据寄生的寄主不同，可将衣原体分成三类：①以人类为寄主。如沙眼－包涵体结膜炎衣原体、淋巴肉芽肿衣原体、鹦鹉热和鸟疫衣原体，可引起眼、泌尿生殖系和呼吸道疾病。②以鸟类为寄主。如鸟疫和鹦鹉热衣原体，可引起人和鸟类的呼吸道及全身感染。③以哺乳动物（除灵长类动物以外）为寄主。如家畜和啮齿类动物衣原体，可引起哺乳动物的呼吸道、胎盘、关节和肠道的疾病。衣原体在光学显微镜下有两种形态：一为原体，又称网状体，直径为200～500nm（毫微米），卵圆形,外周有细胞壁和细胞膜包裹,为衣原体的传染型。另一为始体，较大,直径为600～1200nm，外周亦有细胞壁和细胞膜包裹，为衣原体的繁殖型。衣原体的生活周期是：具有感染性的原体吸附于寄主易感细胞（指对病原体敏感而易受感染的细胞）的表面，随细胞的吞噬作用进入细胞浆，形成能繁殖的始体，始体在细胞浆空泡中进行多次二分裂。后寄主细胞充满多数的小颗粒（即原体）。随后寄生细胞破裂，原体释出，再侵入新的寄主细胞，完成新的生活周期。
衣原体对热较敏感，56℃时 5～10分钟即可灭活，-70℃可保存数年。常用消毒剂如0.1%甲醛和0.5%石炭酸溶液经24小时可以杀死衣原体,75％酒精杀灭力最强,半分钟即可将其灭活。污染的脸盆或毛巾干燥 1小时后其中的衣原体即可全部死亡。金霉素、四环素、氯霉素、磺胺药、利福平、 0.5％硫酸铜溶液等均可抑制其繁殖或将其杀灭。衣原体可用鸡胚培养。哺乳类动物的原代和传代细胞常用于衣原体的分离和培养。衣原体有两种不同的抗原，一为组特异性抗原,为所有衣原体共有,存在于衣原体的胞膜中，耐热，可用补体结合反应和琼脂扩散试验检测。另一为型特异性抗原，可借此将沙眼衣原体和鹦鹉热衣原体分成不同血清型，存在于细胞壁中，可用中和试验和微量免疫荧光法检测。衣原体能产生内毒素，给小白鼠静脉注射可致寄主死亡，能被相应的抗毒素中和。
人类主要的衣原体感染 有以下几种：
沙眼－包涵体结膜炎衣原体感染 ①沙眼。②包涵体性结膜炎。又称“副沙眼”。③泌尿生殖道感染。一般通过性传播。有非淋菌性尿道炎、前列腺炎、附睾炎、子宫颈炎、子宫内膜炎、输卵管炎等。衣原体引起的生殖道炎症与不孕症有关。此外，尚可引起赖特氏综合征（尿道炎－关节炎－结膜炎综合征）等。④新生儿衣原体感染。除包涵体性结膜炎外，尚有肺炎、中耳炎、鼻炎、女婴阴道炎等。
花柳性淋巴肉芽肿衣原体感染 又称“第四性病”。主要通过性接触传播（见花柳性淋巴肉芽肿）。
鹦鹉热衣原体感染 即鹦鹉热，为人鸟共患的衣原体病。
诊断 除依靠典型临床表现外，确诊须根据实验室检查。①直接涂片找包涵体。结膜、尿道和子宫颈刮片或组织切片，用吉耶姆萨氏染剂染色或碘染色，在细胞内可见包涵体。应用免疫荧光抗体染色，可查到细胞内病原体。这些检查均可作为快速诊断。②衣原体分离培养。取相应的标本接种于鸡胚卵黄囊中或 Hela -229、BHk-21等细胞培养中，可以分离培养衣原体。③血清学检查。可用补体结合试验，抗体效价≥1:64即有诊断价值；急性期和恢复期双份血清,抗体效价有4倍以上增高者则诊断意义更大。但补体结合试验的特异性和敏感性均较差。应用酶联免疫吸附试验 (ELISA)或放射免疫法(RIA) 检测抗体，敏感性较高，但不同衣原体之间可有交叉反应。用免疫荧光法检测抗体，不仅敏感性很高，而且可检出不同的衣原体及其血清型。
治疗与预防 可用四环素、红霉素、复方磺胺甲基异唑、氨苄青霉素等全身治疗。对眼部感染可用利福平、四环素、红霉素眼药水滴眼。
预防措施为禁用公共毛巾；产前检查、妇科及泌尿科检查应加查衣原体，发现阳性者给予治疗，并同时治疗其配偶。对鸟类及禽类应进行检疫，尤其对进口的禽类更须注意。
