有75%的男性常常出现早泄，这点被用来说明早泄是“正常的“，但从它的发展来看还是有其生物学基础的。还有一些人基于某些简单的关系而认为早泄的原因并不复杂。例如，有人指出早泄是由于性交频率不足所致，因为许多研究者注意到早泄与性交频率呈负相关。尽管有证据表明很多原发性或终身性的早泄有不受意识控制的生理学或神经学反射的器质性原因，但也有不同的观点。有早泄的男性比没有早泄的男性其球海绵体肌反射（BCR）要快。这一点支持了早泄的男性具有生物学的易感性，导致阴茎更敏感的理论，因此这种情况可能是由于龟头神经的高度敏感性所致，对脊髓神经中枢过多的刺激最终诱发射精。应用生物震撼阈测量法对120名早泄病人和66名性功能正常的男性自愿者的龟头、阴茎体、阴囊和示指（作为对照）的敏感性进行测定，通过这项研究我们已证实了早泄具有这种器质性的病变基础。龟头、阴茎体的生物震撼阈测量参数表明早泄的病人比正常人的明显低，这说明早泄是与阴茎的高敏感性密切相关的。其他人研究了皮层激发电位后发现了类似的结果，指出了早泄男性与正常男性之间的不同之处。通过测量阴茎体和龟头激发电位的潜伏期及振幅，我们测定了34名早泄男性和30名正常男性的皮层躯体感觉的激发电位。早泄病人其支配龟头的背侧神经的平均潜伏期和振幅均比对照组短、小。这说明早泄病人的龟头有高度的敏感性和兴奋性，从而导致无法控制射精。
　　
　　器质性的原因
　　
　　已知一些器质性的损伤和疾病会导致早泄，其中包括腹主动脉瘤手术所致交感神经系统的损伤，骨盆骨折，前列腺增生症和前列腺炎，尿路感染，糖尿病，小动脉硬化，心血管疾病，生殖泌尿系局部的疾病，全身性神经系统疾病和局部感觉器的损伤。其它相对少见的原因包括假性红细胞增多症和多神经炎。