在多形核白细胞内发现革兰阴性双球菌即为阳性。淋球菌呈肾形或卵圆形，常成双排列，凹面相对，大小约0.6-0.8цm,急性期主要分布于细胞内,少数也可分布在细胞外，慢性期则以细胞外为主。取材部位一般为男性尿道和女性宫颈，或有脓性分泌物的部位。也可取前列腺液、精液、尿沉渣检查。本法对有大量脓性分泌物的单纯性急性淋菌性前尿道。尤其是男性淋菌性尿道炎敏感性可达成95%，对慢性淋病、女性淋病患者敏感性较低。女性患者易出现假阳性，此时诊断应慎重。细胞外查到革兰阴性双球菌只可作为诊断线索，需做培养或聚合酶链式反应（ＰＣＲ）检查确诊。淋菌性咽炎涂片检查无意义，因为正常咽部存在其它类型的奈瑟菌。
2、 淋球菌培养及生化试验 淋球菌培养是淋病最重要的检查，有确诊意义。但费时、操作繁琐是其缺点。国外常用Thayer Martin(TM)、New York City(NYC)培养基，国内常用巧克力琼脂或血琼脂培养基，在5%-10%二氧化碳环境（烛缸），温度为36℃，相对湿度为80%以上培养24～48小时观察结果，淋球菌菌落在血平皿上为圆形、湿润、稍凸或平、光滑、透明到灰白色的菌落、边缘呈花瓣状，直经为0.5～1.0mm，易乳化，有粘性，可根据菌落形态、涂片染色做出初步诊断，如氧化试验阳性、糖发酵试验分解葡萄糖则可确定诊断。
3、 单克隆抗体检测法 使用特异性的单克隆抗体，通过抗原—抗体的特异性结合，检查淋球菌抗原，主要有荧光标记和酶标记法，也有人用协同凝集试验（CoA、SPA）检查淋球菌，本检测法操作简单、快速、敏感性强，特异性高。
4、 基因诊断法 用聚合酶链式反应（PCR）、基因探针、连接酶链式反应（LCR）等特殊方法，在DNA分子水平上检测淋球菌的特异性基因片段。此类方法敏感性高、特异性强，可用于慢性、轻症、治疗后复查的患者，但需高精度设备，特殊试验条件，费用较高，对操作人员素质要求较高。注意本检查方法不能区分淋球菌是否存活，患者在治愈后的一段时间内，仍会有死亡的淋球菌排除，基因诊断检查法会持续阳性，所以对于治疗后复查的患者，应在治疗3周后复查。
5、 药物敏感试验 用于确定淋球菌对抗生素的敏感性，指导临床合理用药。淋球菌β-内酰胺酶的检测，可临测PPNG的流行并指导临床使用青霉素。由于淋球菌的耐药性发展很快，不间断检查淋球菌的药物敏感试验，对淋病的防治有重要意义，常用的方法有琼脂稀释法、纸片扩散法、改良碘量法。
